A pesar de que he realizado traducciones de artículos científicos acerca de la planta del cacao, no sé si existe un nombre extendido para denominar al fruto joven.

Aquí está la definición que he encontrado:
"Cherelle Botanique. Jeune cabosse, dont le jeune fruit présente comme l'ovaire, cinq loges dans chacune desquelles les graines sont régulièrement réparties. "
http://www.plante-interieur.com/forum/topic2095-90.html

El fruto del cacao puede llamarse desde "cacao" (el menos concreto), hasta "mazorca", "haba" o "maraca" cuando se quiere hacer más hincapié en la baya. Particularmente encuentro que el término "mazorca" es el que más se utiliza en las publicaciones científicas. No obstante, si tu traducción va destinada a algún país en concreto, puede que te interese investigar si se prefiere otro término en dicho lugar.

Te dejo algunos ejemplos de Google Académico en los que se puede ver el empleo de "mazorca joven" para el fruto joven del cacao:

http://scholar.google.es/scholar?q="mazorca joven" "cacao"&h...

Saludos de nuevo.